Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9D4W2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms