Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tomm20lQ9D4V6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms