Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc83Q9D4V3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc83Q9D4V3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms