Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Ribc2Q9D4Q1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ribc2Q9D4Q1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Ribc2Q9D4Q1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ribc2Q9D4Q1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Ribc2Q9D4Q1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ribc2Q9D4Q1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ribc2Q9D4Q1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Ribc2Q9D4Q1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ribc2Q9D4Q1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms