Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gcc1Q9D4H2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms