Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syce1Q9D495 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms