Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sohlh2Q9D489 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms