Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rufy3Q9D394 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rufy3Q9D394 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms