Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Tmed11Q9D2R4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Tmed11Q9D2R4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Tmed11Q9D2R4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Tmed11Q9D2R4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Tmed11Q9D2R4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Tmed11Q9D2R4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmed11Q9D2R4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Tmed11Q9D2R4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms