Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem53Q9D0Z3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms