Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms