Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nsfl1cQ9CZ44 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nsfl1cQ9CZ44 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms