Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2fQ9CY34 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms