Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nip7Q9CXK8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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