Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmed5Q9CXE7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmed5Q9CXE7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms