Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm5Q9CXE0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm5Q9CXE0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms