Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp23Q9CX11 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms