Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ist1Q9CX00 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ist1Q9CX00 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms