Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU9

Nup37, Nucleoporin Nup37, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup37Q9CWU9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup37Q9CWU9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms