Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH1

Zbtb8a, Zinc finger and BTB domain-containing protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb8aQ9CWH1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb8aQ9CWH1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms