Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atxn3Q9CVD2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atxn3Q9CVD2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms