Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930524J08RikQ9CUJ5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms