Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930535I16RikQ9CUI2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms