Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms