Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sft2d3Q9CSV6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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