Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CR55 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CR55 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CR55 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CR55 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CR55 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CR55 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CR55 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CR55 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CR55 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CR55 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CR55 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9CR55 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9CR55 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9CR55 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9CR55 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9CR55 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CR55 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CR55 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CR55 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CR55 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CR55 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CR55 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CR55 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CR55 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CR55 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CR55 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CR55 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CR55 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CR55 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CR55 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CR55 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CR55 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CR55 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms