Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Atg12Q9CQY1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Atg12Q9CQY1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg12Q9CQY1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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