Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ykt6Q9CQW1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms