Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CQM1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CQM1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CQM1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms