Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd1Q9CQK7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms