Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ndufb9Q9CQJ8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ndufb9Q9CQJ8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms