Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DenrQ9CQJ6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DenrQ9CQJ6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms