Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrpb2Q9CQI7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrpb2Q9CQI7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms