Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmed6Q9CQG0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms