Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ergic3Q9CQE7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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