Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ClpsQ9CQC2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClpsQ9CQC2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms