Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQB7

Lyrm1, LYR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm1Q9CQB7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lyrm1Q9CQB7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms