Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ85

Timm22, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm22Q9CQ85 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm22Q9CQ85 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm22Q9CQ85 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms