Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nudcd2Q9CQ48 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nudcd2Q9CQ48 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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