Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4921530L21RikQ9CQ47 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4921530L21RikQ9CQ47 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms