Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole4Q9CQ36 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms