Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atg3Q9CPX6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atg3Q9CPX6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms