Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt88Q9CPR6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms