Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpl17Q9CPR4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms