Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trim12aQ99PQ1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trim12aQ99PQ1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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