Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cep41Q99NF3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cep41Q99NF3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms