Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ubqln4Q99NB8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubqln4Q99NB8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms