Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ms4a4dQ99N05 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms