Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pramel1Q99MW3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pramel1Q99MW3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms