Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrrtQ99MR6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms